De onderzoeksvragen van CHECK zijn naar aandachtsgebied onderverdeeld. Per aandachtsgebied is een projectgroep samengesteld met leden van de stuurgroep, van de werkgroep en eventueel onderzoekers betrokken bij spin-off onderzoek.

De projectgroepen hebben in eerste instantie tot taak de verzamelde data (dit zijn de gegevens uit de vragenlijsten, het lichamelijk onderzoek, de bloed- en urinemonsters en de röntgenfoto’s) te analyseren, zodat de onderzoeksvragen beantwoord kunnen worden.